Ερευνητές από το Ινστιτούτο Τεχνολογίας της Μασαχουσέτης (MIT) και το Ινστιτούτο Ragon του Cambridge, υποστηρίζουν πως υπάρχει τρόπος εξόντωσης του ιού με δύο τρόπους – είτε να καταστραφεί από το ανοσοποιητικό σύστημα είτε να αυτοκαταστρέφεται. Τα εμβόλια που μέχρι σήμερα είχαν εφευρεθεί στόχευαν στο να διεγείρουν το ανοσοποιητικό σύστημα ώστε να στοχεύσει στις μοριακές υπογραφές που σχετίζονται με ένα συγκεκριμένο παθογόνο. Η ικανότητα όμως του ιού να μεταλλάσσεται κατέστησε δυσχερή τον εντοπισμό αξιόπιστων στόχων στο εμβόλιο.
Οι ερευνητές στην αναζήτηση τους για ένα σωστά στοχευόμενο εμβόλιο, εστίασαν στη μετάλλαξη αμινοξέων τα οποία είναι κατάλληλα στο να εντοπίζουν τον ιό στα μολυσμένα κύτταρα και να τον καταστρέφουν.
Ειδικότερα εξετάστηκαν αμινοξέα των οποίων οι συνδυασμοί μετάλλαξης θα είχαν μεγαλύτερο ποσοστό επιτυχίας ώστε να καταστεί ο ιός μη βιώσιμος. Με τη δημιουργία μιας πολυσχιδούς επίθεσης ενάντια στις περιοχές του HIV, οι ερευνητές παρατήρησαν, ότι ο ιός είτε θα αυτοκαταστρέφονταν είτε θα καταστρεφότανε από το ανοσοποιητικό σύστημα.
Τα αμινοξέα αυτά βρίσκονται στην λεγόμενη περιφέρεια Gaq του HIV και οι ερευνητές χρησιμοποίησαν έναν μαθηματικό τύπο για να την εξερεύνηση τους, τον επονομαζόμενο Random Matrix.
Οι ερευνητές έψαξαν για ένα σύνολο συν-εξέλιξης των ομάδων των αμινοξέων με έναν μεγάλο αριθμό αρνητικών συσχετισμών (δηλαδή, πολλαπλές μεταλλάξεις που θα καταστρέψουν τον ιό) και έναν μικρό αριθμό θετικών συσχετίσεων (δηλαδή ο ιός μπορεί να επιβιώσει μέσω πολλαπλών μεταλλάξεων).
Ο συνδυασμός αυτός βρέθηκε σε μια περιοχή που αποκαλείται τομέας Gaq 3.
Η περιοχή αυτή βοηθάει στην σταθεροποίηση της πρωτεΐνης στο κέλυφος του ιού – πολλές μεταλλάξεις σε αυτό το σημείο, με αποτέλεσμα η δομή του ιού να καταρρεύσει.
Ενδιαφέρον ήταν το γεγονός όταν η ομάδα μελέτησε τον ιό HIV – μολυσμένων ατόμων, των οποίων τα σώματα είναι σε θέση να αποκρούσουν τις επιθέσεις – οι αποκαλούμενοι «εκλεκτοί» - διαπίστωσαν ότι το ανοσοποιητικό σύστημα αυτών των ατόμων στοχεύει επιλεκτικά στον τομέα Gaq 3 σε σχέση με άλλες πρωτεΐνες.
Σύντομα θα αρχίσουν οι δοκιμές σε ζωικά μοντέλα.
Posted in: HIV
